２０××年、Ｍ７．８の直下型地震が襲った東Ｋ市で、唯一甚大な被害が出た「湾岸Ｄ地区」。駆けつけた自衛軍レスキュー班・第四部隊のレイと魚住は、そこで正体不明のセスナ機に爆撃されてしまう！！「第四部隊全滅」が伝えられる中、奇跡的に生き残った２人の前に謎の男が現れて！？　”Ｃｌｅａｎ　Ｃｉｔｙ”物語、第１巻。