そう遠くない未来。魔術が一般化し、インフラとなった世界。 　その裏側で動くのは魔術プラットフォーム「クオリア」。この666階層から成るプログラムの迷宮に電脳ダイブし、メンテナンスする者たちを「マギクス・エンジニア」と呼ぶ。 　借金返済と実益を兼ねて、このエンジニア業界へ飛び込んだ十七歳のナギは、人と関わりたくないあまり誰も来ない深層へと潜っていく。 　そして、一人で黙々と修正を続けていたら――いつの間にかナギは業界の伝説になっていた。