高校入学式の朝、事故で親友を失った常盤侑は、生き残った代償として感情に呼応する異能に目覚める。歪む空間、流れ込む他者の心。教師ルキウス・マーリンに導かれ、権能者の学び舎・東京魔法魔術学院へ。出会いと戦いの中で、侑は親友の死の真相と魔法界の闇に迫り、力の意味を問い続ける。