突如として発生した界蟲と呼ばれる巨大な蟲によって、人類は破滅の時を進んだ。 荒廃した世界に減少する資源、だが人類はそれでも生きるために抗い続ける。 そして百年後の月日が流れ、ここに圧倒的な近接格闘能力とサバイバルセンスを持つ男、瀬能来賀と巨大対界蟲用人型兵器『エクスマキナ』の右前腕を作った天才少女、ローナ・ヴェルスが出会った。 これは、未完成の兵器を使って苦しむ人々のために旅をする二人とその仲間たちの冒険物語である。