トラウマを削除する「記憶削除局」の局員ナギの前に、削除されたはずの記憶の残滓「ユダ」が現れる。「記憶には死に方がある」と語る彼は、消された苦しみが泡のように底から浮かび上がると警告する。やがて世界が崩壊し、ナギは自分が記憶編集プロトコルの失敗による仮想空間にいたことを知らされる。だが現実に戻った彼の指先には、仮想の存在であるはずのユダが残した「青いインク」が確かに滲んでいた。