世界を変えた大変動『パラダイムシフト』。 あらゆる異世界が一つになり、世界は混乱を孕みながらも回り続けていた。 増加する特殊犯罪に対抗する為、特殊事件対策機関『SIRO』は秘密裏に活動していた。 『SIRO』のエージェントであるアマキリ・アヤトは、上司であるミスターQから巷で噂の悪党専門の通り魔『仮面リベンジャー』の捕獲と勧誘を命じられる。 相棒のベルトちゃんと共に捜査に乗り出すアヤトだったが、事件の裏には亡き姉の遺産が絡んでいたのだった。