謎の魔法少女Xが全国メディアを乗っ取り、「テスト」と称して人間の脳を選別する。社会は嘲笑するが、中間テスト当日、国民の半数が同時に爆死。生き残った高校生・迅は、自身の特異な脳が事件に関係していると知り、刑事の親戚と共に次なる期末テストを阻止すべく動き出す。