地球保護を大義名分に異星連合は戦艦02を総旗艦とする侵攻軍を派遣。侵攻軍は地球人類を滅ぼそうとする。しかし総旗艦である筈の戦艦02とそれに搭乗する人造人間、如月蓮は小さな違和感を持つ。その違和感は戦艦02と如月蓮の運命を大きく変える。