深夜、VRMMO「ノヴァ・オンライン」で謎の禁断コマンドを入力した拓真。するとゲーム内NPCたちが手のひらサイズのマスコット美少女になり、現実世界にも現れる。孤独だった開発者の生活は一変し、彼女たちと共に現実と仮想の境界を超えた新たな世界を築くことに——。