巨大地震によって消滅の危機に瀕した近未来の日本。天才科学者を兄に持つヒミコは列島最後の公務員として働き始める。荒廃した国土に巣くう武装した集団と対峙し国の再生を目指すヒミコ。兄タケルは史上最強の兵器を開発するがやがて最先端の科学の迷宮に陥る。ヒミコは日本を救えるのか。