人類に叛旗を翻した巨人型ガイノイド（女性型アンドロイド）から世界を救った女神型ガイノイド、レギンレイブは、その戦いの余波で異世界へと飛ばされてしまう。
転移した大陸は、その世界で選定の大陸と呼ばれる、人類の命運を決める特異な大陸だった。
そんな大陸で再起動した彼女は、自分を創造したマスターと同じ名、同じ遺伝子を持つ少年ユミルと出会う。
レギンは少年の夢を叶えるため、選定の大陸を彼と共に旅をする。