中学でタイムに縛られる日々に疲れた森山風花は、高校でクロスカントリー部に入部する。 しかし、そこで出会ったのは、勝利だけを追い求める孤高のランナー、清沢凛だった。 正反対な二人は衝突するが、ある練習中のアクシデントをきっかけに、互いの心の奥に秘めた『見えないゴール』を知る。 風花は走る喜びを、凛は病弱な妹への想いを胸に抱えていた。 そんな中、二人の大切な練習場所である森に、学園の再開発計画が持ち上がる。森を守りたいと願う風花は、森の保全活動をはじめる。当初は戸惑っていた凛も、風花に共感し、二人それぞれの『ゴール』が一つになっていく。 やがて風花の提案により、部員たちは森を守るため、大会優勝を目指すことを決意。 タイム至上主義だった凛も、仲間と共に走る新たな目標に向かって走り出す。