かつて地球を襲った宇宙怪獣は一人の少女のほぼ全ての記憶、『思い出』を代償とした超能力によって殲滅された。再び襲来が予測される宇宙怪獣に対抗するため、『ポンコツ』となった少女と、各国の『はみ出し者』のスパイ達で疑似家族を形成し、守りたい『思い出』を作ることで少女を『再生』する計画が秘密裏に発動される――