雲海の上に小さな島々がある…。長い歴史の間、人類はその空で”竜”に怯えながら慎ましく暮らしていた。しかし科学技術の進歩は機械で作られた人工の竜「飛竜機（ドラゴンファイター）」を生み出し、人類は竜に対しての反撃を開始した。 　「竜騎兵」を目指す士官学校「スカイ・ライン」の入学試験にて空軍元帥の息子「グリフォン」は平民出身の敏腕騎兵「リュウセイ」との出会い、世界の謎を解き明かす戦いに身を投じていく…。