大道連盟の管理下に置かれた、中世の日本、極東。 それの遥か上空を航行する、船艦都市_高天原には学生達が大勢住まい、日々平和を過ごしていた。 だが、高天原の行き先である、武蔵国。そこで、彼等は一人の少女と出逢うことにより、思いもよらない騒動に巻き込まれる。 “聖なる姫御子”とは一体なんなのか？ 日本の戦国時代と、宗教戦争を舞台にした、学園国家間戦争が始まる！