相棒であるフィリップが消えて半年後、左翔太郎は探偵として、仮面ライダージョーカーとして風都の平和を守っていた。 そんなある日、翔太郎はドーパントと遭遇、そのドーパントの能力によりビギンズナイトの後、亜樹子が風都に来る前の時間に飛ばされる。 ２年前の11月9日、それはＷにとって｢思い出したくない事件｣が起こった日だった…。