２０９０年代、二大勢力に分かれつつある地球上において、有人人型ロボット兵器「機動兵士」を導入することになった日本。それを駆る少年少女たちは、超国家機密計画によりある手段を施された強化人間だった。彼らの戦地での活躍と葛藤を描いた物語である。