かつて地上の世界は争いや天災で住めなくなってしまった。 人々は地下に移住し、そこで高性能のAI、通称【機械皇帝】に縋り、生きてきた。 ある日、エンジニアであるイオが機械皇帝の異常を見つけたところ、この国を巡る事象に巻き込まれて行く。