巨大地震によって消滅の危機に瀕した近未来の日本。天才科学者を兄に持つヒミコは最後の公務員として働きはじめる。荒廃した国土に巣くう武装した集団と対峙し、国の再生を目指すヒミコ。兄タケルは史上最強の兵器を開発するが、やがて最先端の科学の迷宮に陥る。ヒミコは日本を救えるのか。