青い雨が天へ降るたび、空気の色が変わり、人々は知らぬ間に消えていく――。 その秘密を知ってしまった篝八千は、政府非公開の研究組織「碧雨研究機関」に連れ去られる。 雨の正体、“碧落”とは何か。 普通の少年だった八千は、やがて人類の境界を超える戦いに巻き込まれていく。