伝説の父と比べられ、雲作りへの自信を失った見習い雲師ソラ。空を見ることさえ恐れていた彼の元に、ある日、少年から「友達への謝罪の雲を作ってほしい」という風変わりな依頼が舞い込む。 その小さな願いが、彼の運命を大きく動かしていく。 やがて町が深刻な干ばつに襲われた時、ソラは父の教えではなく、自分だけのやり方で空に奇跡を描こうと決意する。これは、一人の気弱な少年が、本当の強さを見つける物語。