「マリン計画」を進める建設公団理事長シャイロック氏が謎の死を遂げ、その犯人を追いかけるべく海底特急マリン・エクスプレスに無免許医B・Jと共に乗り込んだ探偵・伴俊作。しかし殺人事件は車両内でも発生し、更にシャイロック同様その死体は消失する──。海底資源争奪や自然破壊を伴う「マリン計画」を巡り、様々な思惑が動き出す第2弾!!