高校二年生の倉科ソウは、料理ができず母の死後は温かい手料理から遠ざかっていた。そんなある日、屋上で謎めいた転校生・星川アイに出会う。彼女は昭和時代の少女のような古風な佇まいで、時間料理師という特別な能力を持っていた。アイは50年前から時空に囚われており、自分の時代に戻るために「思い出の味」という感情と愛情を含む料理のレシピを完成させなければならないと告げる。 　ソウは母の料理の記憶を提供し、アイの技術とともに過去の味と感情を再現し始める。やがてクラスメイトたちも協力し、各々が抱く家族や友人の味の記憶を持ち寄ることで、レシピは完成の兆しを見せる。料理に愛情の分量を込めるという未知の要素がレシピの鍵だった。 　レシピの完成にともない時空の歪みは修復されるが、アイは1970年の時代に帰らなければならず、別れを惜しみながら透明になって消えていく。彼女は「思い出の味」が愛情と笑顔で決まることを残し、ソウたちは料理部を結成し、思い出の味を再現し続ける決意を新たにする。