リリス・クロノスは、人見知りで目立つことの苦手な少女。 だが彼女の正体は――時をあやつる「時空の魔女」 極秘の任務を背負い、彼女は貴族たちが集う名門学園《アストラリア魔術学園》へ潜入することになる。 慣れない学園生活、初めての寮生活、そして個性豊かな仲間たち。 胸に隠した力と秘密を抱えながら、リリスの日々は静かに動き出す。