英国に存在する魔法学専門校『グリーンメルディン校』。そこに在籍する魔術師の卵、シャーロック・スミスと筋金入りのシャーロキアン、ジョニー・Ｆ・ホームズ、二人は校内でこう呼ばれていた――『魔法探偵シャーロック＆ホームズ』と。二人は次々と魔法による怪事件に挑み、それら全てが一つの線で繋がっていたことを知る。