立ち向かえ、千年紡いだ、この愛のため。時は明治──。新時代に浮足立つ、華やかな帝都。美術商の父と暮らす双葉(主人公)が手にしたのは、古い神楽鈴。それは陰陽師の力を目覚めさせる鍵だった。「その力で、帝都を守ってほしい」戸惑う双葉の前に現れたのは前世の縁で結ばれた妖(あやかし)たち。「思い出したんだ。最期の約束を」文明開化の影でうごめく陰謀。次第に明らかになる千年前の悲劇。今再び、双葉と妖の運命の物語が始まる──…。