減刑を条件に、犯罪者たちが政府の汚れ仕事を担う特殊部隊スーサイド・スクワッド。 かれらを率いる指揮官アマンダ・ウォーラーが、次なるターゲットとして狙いを定めたのは……バットマン最大の宿敵、ジョーカーであった。 犯罪界の道化王子を捕らえるべく、ウォラーはジェイソン・トッド（二代目ロビン）を仲間に引き入れることに。 その一方で、ジョーカーはスーサイド・スクワッドを自らの傘下に置く計画を進めていた……。 悪党たちの思惑がぶつかり合うなか、誰が最後に笑うのか!? 前代未聞の戦いが幕を開ける！