文明が崩壊し、魔法が再び力を持った遠い未来。少年カイルは、かつて発掘した神代の機体『レガリア・ディープワン』に乗り、最前線の戦場に立つ。旧帝国の遺産である敵レガリア三機との激戦の末、辛くも勝利するが、彼の機体も限界を迎えていた。命を削りながら戦うその先に、『真の目覚め』が待つとは、まだ誰も知らない――。 これは、一人の発掘者と神機体が刻む、戦火の記録である。