高校２年生の如月六角は平凡な高校生活を送っていた。しかし、ひょんなことから「ネジ」の存在や「ネジ」や人々を密かに守る「NUT」、そして「ネジ」を奪う「イーヴル」の存在を知る。 六角は小学生の頃「イーヴル」に奪われた親友の「ネジ」を取り返すために「NUT」への所属を決意するのだった。