江戸時代。 北町奉行所同心・夜薙雨源次は、心の中に鋭利な何かを抱えながら日々を過ごしていた。 ある日、押し込みの罪で捕まっていた男が牢屋敷から逃げ出した。 男の手がかりを求めて訪れた[わたりや]という駕籠屋で夜薙は、江戸の闇に触れることになる。 卓越した「業」を駆使し、人々の晴らせぬ恨みを晴らす、「黒業師」たちの物語。