「暗殺者 キリヤ Ⅱ」の続編となります。 季節は冬。東京の外れにある廃工場の中で、一組の男女が暮らしている。 名をキリヤと美乃華という。 穏やかな日々を過ごしていた二人に殺害依頼（オーダー）が入る。 二人はさまざまな闇を抱える人間達と出会い、殺していくのだった――。