当たり前のように魔法が行使される世界で主人公は魔法について専門で学ぶ魔導高校に進学する。１００人しか入学できないその学校で、主人公は序列９９位。入学式の朝、主人公は一人の少女とぶつかる。その時感じた熱、それは――――。

　序列９９位と１００位の少女たちが、学内の模擬戦トーナメントで上位者たちを打ち負かしていくバトルマギカエンタテインメント、開幕！！