家宝である刀を納めるべく、蛇ヶ島を訪れた蛇功。だが、そこでは百年に一度の大渇水が起こっていた。そこで黒い蛇のような邪霊に襲われそうになった蛇功は、透花という美少女に弓矢で助けられる。謎の島から脱出した翌日、学校で透花と再会する。そして、島を呪う百蛇神と戦うと言い出して――！？