京都大学の宇宙論教授・深海悠人のもとへ届いた消印なき羊皮紙──そこに記された「我々は最果てへとたどり着いてしまった」の一文は、未来からの警告だった。教え子・芹澤澪と解析を進めるうち、人類が必ず直面する破滅的関門“グレートフィルター”が浮かび上がる。二人は種の存続を懸け、〈未来の知を過去へ送り込む〉逆因果通信という禁断の計画に挑むが、その代償は計り知れない──。