中学一年生の由乃は、ある日突然、不気味な中学校──都市伝説中学校に迷い込んでしまう。
この学校は選ばれた者だけが通える謎の学び舎であり、学校を仕切るのは白髪のミステリアスな少年・冥音だった。
冥音は都市伝説を学ぶことを目的とし、生徒たちに奇妙な授業を課していく。

学校から脱出するためには冥音が課す最終テストをクリアしなければならない。

そのテストの内容は【この学校から本当に出たい理由を言葉にせよ】というものだった。