小さくなった神『アマテラス』は、最強でかわいい。 —神が人を創り、人が妖を産んだ。 地上より、遥か上空、神界で起こった神対神の戦争。 最強の神・アマテラスは、妖（あやかし）を纏（まと）った邪神達に敗北。 その肉体は地上へと堕ち、東京スカイツリーに突き刺さる――。 その現場を唯一目撃した平凡な高校生・駿河誠一は、弱り切ったアマテラスを「器」として受け入れる。