永い安定を見せていた生態系は魔禍《まか》と呼ばれる超常的で無差別な進化により破られる。 魔禍を狩り今の生態系を守る狩人の魔法使い、その一人であるクラウドは任務の中で不死狩の少女ウィンディと出会う。 強さを持つが孤高のクラウド、特別だが非力に憂うウィンディ。二人は互いの中に自分にはないモノがあることに気づいてゆく。