退廃都市ムサシで、クイーンとジャックは過去の実験施設の闇に復讐を誓う。殺し屋として標的を追う中、ニギタマ製薬の陰謀に立ち向かう。姉弟の絆と怒りが、サイバーシティで激突。おのれの存在を刻むため、彼らの闘争が始まる。