陰陽師の父と九狐の母の力を受け継ぐ双子の兄妹。天堂夜空と天堂星は半妖でありながら母の呪いを解くため。陰陽師を目指す決意を仲間と決め、渋谷陰陽師高校専門学校。通称渋谷陰陽高専に通い、日々を過ごす。入学から２ヶ月。夏が目前、 ある日。夜空達は｢東京で人の形をした妖が出て、夜中に人を脅かしている｣と噂を学校内で聞き、理事長で陰陽頭の土御門辰馬からの指示で初陣にでた天堂隊。 初の初陣を迎えるなか。天堂兄妹を狙う 蘆谷道満が率いる黒星宗教団も動き始める。 天堂兄妹の父の行方、｢半妖｣として本当の力が明らかに…