巫 那由多(かんなぎ なゆた)は物心着いた頃には目を見たら人を呪ってしまうと言われ、目隠しをされた状態で兄である巫 阿頼耶(かんなぎ あらや)と共に育った。 閉鎖的な空間で彼らは「実験材料」として扱われているのだ。 理不尽な苦痛を与えられる中で、那由多は阿頼耶を傷つける人間に憎しみを募らせていく。