高校三年生の藤宮翔真は、受験生だが勉強嫌いだ。 夏休みのある日、夏期講習をサボるため、翔真は一人で寂れた神社に行く。 そこには、桐生菖蒲という一人の少女がいた。 翔真は彼女と神社で交流を深めていくが、菖蒲は突然姿を消してしまう。 あの夏の記憶が焼きついて、消えない。 いつまでも。 大人になっても。 ――そして時は動き出す。