高校生探偵・工藤新一は、毛利蘭と一緒に出来たばかりの「トロピカルランド」にやってきたが、そこで黒ずくめの男たちの怪しい取引を目撃する。しかしその瞬間、何者かに薬物を飲まされて、気がつくと体が小さくなっていた!!工藤新一が江戸川コナンになる、このあまりにも有名な第1話には、原作でも描かれてこなかった真の第1話があった!あの日、あの時、登場人物たちそれぞれにいったい何があったのか?今、ここに初めて明かされる!