舞台は2237年の近未来都市、帝都。 弍本国（にほんこく）において大きな発展を遂げたこの都市に、バーチャル世界と現実世界を融合させたエンターテイメントシティ「イマーシブ・ポートシティ」が、リニューアルオープンしようとしていた。 ポートシティの前身「ネオシティ・トーキョー」の時代から、警備隊STARSで警備員をしてきた篠崎夜明（シノサキ　ヨア）は、春から新生STARSにて隊長に抜擢された、不思議な左目の異能を持つ青年。 リアルとバーチャルの境界を犯しつつある“怪異”と、その源である“粒砂”の謎を追っていた夜明は、その過程で紫咲（ムラサキ）と名乗る謎の女性と出会う。 ひょんな事から共に組んで事件を解決していく事になり、交流を深める事で、お互い少しずつ惹かれていく夜明と紫咲。 そして彼らは、このポートシティ全体を巻き込む大きな謎と運命に巻き込まれていく――