人類史上初の地球統一政府として成立した、神聖旭日連邦帝国は太陽系全域への進出を開始した。そして火星へと到達した人類は、衝撃の事実を知る事になるのであった。 紆余曲折を経て太陽系全域を統一し近隣の星系へと進出を開始した神聖旭日連邦帝国は、強大な敵との争いに巻き込まれていく。 こうして人類の命運をかけた新世紀宇宙戦争が始まるのであった。