科学技術が発展し、いくつかの人類の問題が解決し明るい未来を迎えようとしていた人間の前に敵が現れた。 エネミーと呼称されるようになるその敵に人類は数を減らし、居住区を追いやられた。 エネミー対策部隊《ホープ》の訓練生、アレクセイ＝小林は仲間が目の前で食い殺される惨劇を生き延び、同じように逃げた少女と出会う。 彼らは生き延びるために協力することになる。 しかし、彼らは気が付く。 本当の敵は別にいることに。