西暦2677年。 人類が光速での飛行を可能にしてから、約半世紀が過ぎようとしていた。 昨年まで続いていた、統一戦争が終結。 地球は一つの国家としてまとまり、新たなステージへと踏み込んだ。 戦後の治安維持のために配備された、陸・海・空・宙の各軍。 その中の『宙』、宇宙軍。 宇宙軍第一主力艦隊が、太陽系外縁領域であるエッジワース・カイパーベルトにて探査を行っていた。 そんな最中、一隻の船影が、第一艦隊のレーダーに映る。 未確認ID、アンノウン。 この未知との遭遇が、地球を更なる宇宙の深淵へと引きずり込んでいくことになるのだった…。