かつての冷酷な暗殺者、ウィンター・ソルジャーことバッキー・バーンズ。 空を駆けるヒーロー、ファルコンことサム・ウィルソン。 ある日、二人は謎の少年“ナチュラル”と出会ったことがきっかけで、悪の組織ヒドラの次期総統を決める戦いに巻き込まれていく。 新たな総統の正体とは？ 二人は世界のため、ヒドラを止めることができるのか？