三年目、世界中に隕石が飛来した。飛来した隕石に乗り込んでいたのは人語を解する蟻――自分たちを〈天上蟻〉と称する巨大な蟻であった。 しかし蟻たちは人間に「あること」を伝えて全て息絶える。それと同時に地面はあちらこちらに穴が開き、そしてそこから〈地底蜂〉が姿を見せるようになった。 鏑矢(かぶらや)ユギトは高校入試の日、父の墓参りの帰りに運悪く〈地底蜂〉に遭遇する。 それは彼の異能を開花させ、そして〈地底蜂〉との戦いに引きずり込む「始まり」であった。