USP隊員ハヤタ・シンはウルトラと呼ばれる異星人と融合し、超人「ウルトラマン」に生まれ変わった。 ハヤタはベーターカプセルによってウルトラマンに変身し、超人的な怪力、飛行能力、エネルギー光線発射能力などの超能力を発揮するが、 その持続時間はわずか3分間である……。