高校でいじめを受けていた、都内の公立高校二年生、緋村蓮は夏休みのある日、突然〈炎〉を操る力に目覚めていじめの首謀者を心ならずも人知れず焼き殺してしまう。パニックに襲われてた最中に、そうした特殊な超常的な力を持つ者〈異能者〉の秘密結社〈ナイツ〉に取り込まれ〈炎聖〉のコードネームを与えられて、雷使いの〈雷帝〉こと千堂円を相棒に、愛刀〈十六夜〉片手に特異な事件に斬り込んで行く。